Data Stellare 5554.4: L'Enterprise ha l'incarico di sorvegliare Pilos: la squadra di sbarco si imbatte in una forma di vita vegetale insolita, una pianta mobile che si sposta con delle radici simili a zampe e si difende grazie a spine velenose. Sulu si punge accidentalmente, ma viene curato da Agmar, membro della specie di vegetali senzienti indigena del pianeta. La popolazione pilosiana era stata decimata da batteri introdotti nel recente passato da Stavos Keniclius, che in seguito aveva cercato invano una soluzione, stabilendosi poi sul pianeta. Spock viene catturato da rapaci vegetali su ordine di Keniclius 5. Le armi risultano essere inattive a causa di un campo di smorzamento presente nell'atmosfera del pianeta, perciò il resto della squadra torna sull'Enterprise per studiare una linea di azione. Dall'archivio del computer si scopre l'identità di Keniclius, Scott e McCoy si apprestano, quindi, a preparare un equipaggiamento efficace per salvare Spock. Kirk, McCoy e Sulu contattano Agmar, che li conduce dal prigioniero. Il piano di Keniclius viene scoperto da Uhura: un progetto di clonazione con cui creare esemplari giganteschi in cui trasferire la coscienza dell'originale, una specie superiore che imponga la pace nella galassia; ma la clonazione di Spock è già avvenuta. McCoy usa un siero da lui sintetizzato per stordire i Pilosiani, Scott riesce a superare il blocco delle comunicazioni e contatta il clone gigante raccontandogli del passato di Keniclius. Il clone di Spock, dopo aver guarito l'originale grazie ad una fusione vulcaniana, convince lo scienziato a desistere dal suo piano e lo invita a lavorare insieme a lui per ricostruire la civiltà pilosiana.