Nella galassia il tempo ha smesso di scorrere lungo il suo corso normale, e questo significa che il Guardiano del Sempre non sta funzionando correttamente. Spock, Kirk e McCoy devono tornare indietro nel passato di 5000 anni per trovare il figlio di Spock, Zar, in modo da poter entrare in contatto telepatico con il Guardiano.