È una direttiva classificata nota solamente ai capitani di astronave e ai loro superiori che supera per importanza anche la Prima Direttiva.

Quando i sensori rilevano una particella omega, il computer di bordo disattiva tutti i sistemi, si pone in «omega mode»: vengono isolati i comandi di tutte le postazioni tranne quella del Capitano e su tutti i monitor compare la lettera omega maiuscola dell'alfabeto greco, per segnalare lo stato del computer. In questa condizione il Capitano ha il dovere di rintracciare la sorgente della particella omega e distruggerla.